Contribución de los datos genómicos en la definición de la composición racial de bovinos doble propósito
DOI:
https://doi.org/10.22319/rmcp.v12i4.5690Palabras clave:
genotipado, mestizos, variabilidad, genéticaResumen
La heterosis animal es clave en la obtención de animales más productivos y mejor adaptados al trópico. Sin embargo, el inadecuado manejo genético conlleva a la obtención de mosaicos de razas que incluye la pérdida del potencial productivo del hato. El objetivo de este estudio fue definir la composición racial de bovinos mestizos doble propósito en el piedemonte Llanero departamento del Meta-Colombia. Un total de 126 individuos mestizos (MEZ) de seis hatos fueron evaluados por una aproximación fenotípica (APF) y una genotípica (ARG). Para ARG se incluyeron las razas control asociadas a Bos taurus taurus y Bos taurus indicus, para ello se genotiparon con un chip de GeneSeek GGP-LD de 26K de SNP y se analizaron mediante análisis de componentes principales (PCA) y asignación probabilística bayesiana de ADMIXTURE. Las agrupaciones raciales generadas por APF variaron respecto de ARG. El análisis molecular detectó siete (k= 7) grupos genéticos en la composición racial de los animales de estudio. Las tres razas con mayor participación en la composición racial de los individuos mestizos fueron: Holstein, Gyr, Brahman con 23.4, 21.4, y 21 % respectivamente, mientras que las restantes Blanco Orejinegro, Pardo Suizo, Normando y Jersey no superaron el 13 %. A diferencia de APF, la aproximación ARG permitió de forma efectiva la identificación de la composición racial de bovinos mestizos y suministró información clave en miras de desarrollo de programas de apareamiento que buscan mejorar indicadores productivos, y a su vez propendan por la adaptación de los animales requisito indispensable para los sistemas bovino doble propósito.
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Federación Colombiana de Ganaderos- FEDEGAN. Cifras de referencia del sector ganadero colombiano.2018. https://www.fedegan.org.co/estadisticas/documentos-de-estadistica.
Ortega LE, Ward RW, Andrew CO. Technical efficiency of the dual-purpose cattle system in Venezuela. J Agr Appl Economy 2007;39:719-733.
Pariacote FA. Perspectivas de mejoramiento genético del bovino criollo. En Duran C, Campos R, editores. Perspectivas de conservación: Mejoramiento y utilización de recursos genéticos criollos y colombianos en los nuevos escenarios del mejoramiento animal. Palmira-Valle del Cauca. UN-Palmira. 2008:17-30.
Vergara GOD, Flórez MJM, Hernández PMJ, Yaguna GCJ, Manco JC, Barrios RTE, Rico CJ. Efectos raciales, de heterosis y parámetros genéticos para peso al nacer en una población multirracial de ganado de carne en Colombia. Livest Res Rural Develop 2014;26(58).
Echeverry ZJ, Salazar RVE, Múnera D. El cruzamiento como estrategia para mejorar la rentabilidad de hatos lecheros. Revista Lasallista de Investigación. 2006, 3 (julio-diciembre):<http://www.redalyc.org/articulo.oa?id=69530209> ISSN 1794-4449. Consultado 25 Abr, 2019.
Elzo MA. Evaluación Multirracial de Bovinos en Colombia: desde la genética a la genómica. Departamento de Ciencias Animales, Universidad de Florida, Gainesville, FL. Estados Unidos. 2011.
Frankham R, Ballou JD, Briscoe DA. Introduction to conservation genetics. Cambridge, UK: Cambridge University Press; 2002.
Gorbach DM, Makgahlela ML, Reecy JM, Kemp SJ, Baltenweck I, Ouma R, et al. Use of SNP genotyping to determine pedigree and breed composition of dairy cattle in Kenya. J Anim Breed Genet 2010;127:348–351.
Akanno EC, Chen L, Abo-Ismail MK, Crowley JJ, Wang Z, Li C, Basarab J, et al. Genomic prediction of breed composition and heterosis effects in Angus, Charolais and Hereford crosses using 50K genotypes. Can J Anim Sci 2017;97:431–438.
Bolormaa S, Hayes BJ, Hawken RJ, Zhang Y, Reverter A, Goddard ME. Detection of chromosome segments of zebu and taurine origin and their effect on beef production and growth. J Anim Sci 2011;89(7):2050-60.
Otero AE, Mosquera AL, Silva CG, Guzmán VJC. El Piedemonte. La Orinoquia de Colombia. Bogotá: Banco de Occidente 2014. ISBN 95896774968.
Villasmil IW, Aranguren-Méndez JA. Clasificación fenotípica en vacas mestizas. En: González-Stagnaro C, Soto-Belloso E, editores. Manual de Ganadería Doble Propósito. Maracaibo-Venezuela: Ediciones Astro Data, S.A; 2005;8(1):283-290.
Li Y, Levran O, Kim J, Zhang T, Chen X, Suo Ch. Extreme sampling design in genetic association mapping of quantitative trait loci using balanced and unbalanced case-control samples. Sci Rep 2019;9:15504. https://doi.org/10.1038/s41598-019-51790-w.
R Core Team R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing 2014: Vienna, Austria. http://www.R-project.org/.
Alexander DH, Novembre J, Lange K. Fast model-based estimation of ancestry in unrelated individuals. Genome Res 2009;19(9):1655-1664.
Neves HHR, Carvalheiro R, Fries LA, Queiroz SA. Uso combinado de sêmen sexado e acasalamento dirigido sobre uma população de bovinos de corte submetida a seleção: estudo de simulação. Rev Brasileira Zoot 2009;38:2368-2374.
Perdomo-Carrillo D, Perea F, Soto-Belloso E, Piña-Monsalve J, Moratinos-López P, Martínez-López M, Perea-Brugal M. Efecto de la raza paterna sobre el desempeño productivo de un rebaño de vacas mestizas doble propósito en Venezuela. Maskana 2017;8:141-143. https://publicaciones.ucuenca.edu.ec/ojs/index.php/maskana/article/view/1509
Zambrano R, Santos H, Contreras R, Moreno A, Chirinos Z. Características productivas de un rebaño mestizo bovino doble propósito comercial en Venezuela. Actas Iberoam Conserv Anim 2013;3:15-19.
Galeano AP, Manrique C. Estimación de parámetros genéticos para características productivas y reproductivas en los sistemas doble propósito del trópico bajo colombiano. Rev Facultad Med Vet Zoot 2010;57(II):119-131.
FAO. Food and Agriculture Organization of the United Nations. Phenotypic characterization of animal genetic resources. FAO Animal Production and Health Guidelines. Rome. 2012.
Salamanca-Carreño A, Vélez TM, Bentez MJ. Efectos no genéticos sobre la reproducción en vacas mestizas con predominio Bos indicus en el municipio de Arauca, Colombia. Rev Invest Vet Perú 2017;28(1):101-109. https://doi.org/10.15381/rivep.v28i1.11749.
Wang Y, Wu X-L, Li Z, Bao Z, Tait RG Jr, Bauck S, Rosa GJM. Estimation of genomic breed composition for purebred and crossbred animals using sparsely regularized admixture models. Front Genet 2020;11:576.
Strucken EM, Al-Mamun HA, Esquivelzeta-Rabell C, Gondro C, Mwai OA, Gibson JP. Genetic tests for estimating dairy breed proportion and parentage assignment in East African crossbred cattle. Genet Sel Evol 2017;49(1):67. doi.org/10.1186/s12711-017-0342-1.
Cortés H, Aguilar C, Vera R. Sistemas bovinos doble propósito en el trópico bajo de Colombia. Modelo de simulación. Arch Zootec 2003;52:25-34.
Ahmad SF, Panigrahi M, Chhotaray S, Pal D, Parida S, Bhushan B, Gaur GK, et al. Revelation of genomic breed composition in a crossbred cattle of India with the help of Bovine 50K BeadChip. Genomics. 2020; 112(2):1531-1535. doi: 10.1016/j.ygeno.2019.08.025. Epub 2019 Aug 28. PMID: 31472242.
Ramírez-Toro EJ, Ocampo-Gallego RJ, Burgos-Paz WO, Elzo MA, Martínez-Sarmiento RA, Cerón-Muñoz MF. Estimación poligénica y genómico-poligénica para características de crecimiento en ganado Blanco Orejinegro (BON). Livest Res Rural Develop 2019;31:30.
Aranguren-Méndez J, Román R, Villasmil-Ontiveros Y. Evaluación genética de la ganadería mestiza doble propósito en Venezuela. XX Reunión ALPA, XXX Reunión APPA-Cusco-Perú. Arch Latinoam Prod Anim 2007:15(Supl 1):241-250.
Akanno EC, Chen L, Abo-Ismail MK, Crowley JJ, Wang Z, et al. Genomic prediction of breed composition and heterosis effects in Angus, Charolais, and Hereford crosses using 50K genotypes, Can J Anim Sci 2017;97(3):431-438.
Orgogozo V, Morizot B, Martin A. The differential view of genotype-phenotype relationships. Front Genet 2015;6:179.
Gobena M, Elzo MA, Mateescu RG. Population structure and genomic breed composition in an Angus–Brahman crossbred cattle population. Front Genet 2018; 9:90. https://doi.org/10.3389/fgene.2018.00090.
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