Diversidad genética de gallinas criollas en valles centrales de Oaxaca usando marcadores microsatélites
DOI:
https://doi.org/10.22319/rmcp.v12i1.5109Palabras clave:
Aves locales, SSR, Diversidad genética, Recursos zoogenéticosResumen
Las poblaciones de gallinas criollas en explotaciones en pequeña escala poseen una gran diversidad y son parte del reservorio genético avícola en México; además, constituyen una importante fuente de proteína para las familias del medio rural. Con el propósito de conocer la variabilidad genética de poblaciones de gallinas criollas en la región central de Oaxaca, se tomaron muestras de sangre de 109 gallinas criollas, provenientes de 17 poblaciones y de 30 gallinas Plymouth Rock como testigos. Se usaron 10 marcadores de tipo microsatélites, con los que se detectó un total de 109 alelos, con 10.9 ± 3.1 alelos por locus en promedio. La heterocigosidad observada (Ho) varió de 0.575 (San Lucas) a 0.750 (San Antonino 2) y la esperada (He) de 0.625 (Testigo) a 0.733 (Huixtepec 2). A nivel general se encontró un incremento en el número de heterocigotos evidenciado por un nivel de endogamia global (FIT) de 0.042; el índice FST de diferenciación entre poblaciones fue moderado (0.059) y la endogamia de individuos dentro de poblaciones (FIS) resultó negativa (-0.017), lo que indica un exceso de heterocigotos a ese nivel. El análisis de conglomerados agrupó a las poblaciones de Nazareno, ITVO, San Lucas y San Antonio, evidenciando que son poblaciones de gallinas criollas aisladas y diferenciadas genéticamente en algunas características. Esta información es importante para diseñar futuros programas de conservación, selección y multiplicación de esta especie a nivel de traspatio en la región central de Oaxaca, México.
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Abebe AS, Mikko S, Johansson AM. Genetic diversity of five local Swedish chicken breeds detected by microsatellite markers. PLoS One. 2015;10(4):1–13.
FAO. La situación de los recursos zoogenéticos mundiales para la alimentación y la agricultura. Food Agric Organ United Nations. 2010.
FAO. Recursos genéticos animales 56. Food Agric Organ United Nations. 2015;171.
Kaya M, Yildiz MA. Genetic diversity among Turkish native chickens, Denizli and Gerze, estimated by microsatellite markers. Biochem Genet 2008;46(7–8):480–91.
Muir WM, Cheng HW. Genetic influences on the behavior of chickens associated with welfare and productivity. 2nd ed. Genetics and the behavior of domestic animals. Elsevier Inc. 2014. http://dx.doi.org/10.1016/B978-0-12-394586-0.00009-3.
Dorji N, Daungjinda M, Phasuk Y. Genetic characterization of Thai indigenous chickens compared with commercial lines. Trop Anim Health Prod 2011;43(4):779–85.
Qu L, Li X, Xu G, Chen K, Yang H, Zhang L, et al. Evaluation of genetic diversity in Chinese indigenous chicken breeds using microsatellite markers. Sci China, Ser C Life Sci 2006;49(4):332–341.
Sukhatme, PV. Sampling Theory of Surveys with Application. Iowa State College Press. Ames, Iowa. 1970.
Crooijmans RP, van Oers PA, Strijk JA, van der Poel JJ, Groenen MA. Preliminary linkage map of the chicken (Gallus domesticus) genome based on microsatellite markers: 77 new markers mapped. Poult Sci 1996;75(6):746–54.
Ya-bo Y, Jin-yu W, Mekki DMM, Qing-Ping A, Hui-Fang L, Rong G, et al. Evaluation of genetic diversity and genetic distance between twelve Chinese indigenous chicken breeds based on microsatellite markers. Int J Poult Sci 2006;5(6):550–556.
Horbańczuk JO, Kawka M, Sacharczuk M, Cooper RG, Boruszewska K, Parada R, et al. A search for sequence similarity between chicken (Gallus domesticus) and ostrich (Struthio camelus) microsatellite markers. 2007;25(4):283–288.
SAS 9.4 Software. Institute Inc., Cary, North Carolina, USA. 2016.
Al-Qamashoui B, Simianer H, Kadim I, Weigend S. Assessment of genetic diversity and conservation priority of Omani local chickens using microsatellite markers. Trop Anim Heal Prod 2014;46:1–6.
Antos P, Andres K, Kapkowska E. Preliminary studies on genetic diversity of selected Polish local chicken varieties. J Cent Eur Agric 2013;14(1):11–22.
Bao WB, Shu JT, Wu XS, Musa HH, Ji CL, Chen GH. Genetic diversity and relationship between genetic distance and geographical distance in 14 Chinese indigenous chicken breeds and red jungle fowl. Czech J Anim Sci 2009;54(2):74–83.
Mukesh. Ruheena J, Uma G, Han J, Sathyakumar S. Cross-species applicability of chicken microsatellite markers for investigation of genetic diversity in Indian duck (Anas platyrhynchos) populations. African J Biotechnol. 2011;10(76):17623–17631.
Illel JH, Roenen MAMG, Reidlin PJF, Äki AM, Ortwijn MO. Biodiversity of 52 chicken populations assessed by microsatellite typing of DNA pools. Genet Sel Evol 2003;35:533–557.
Esfahani EN, Eskandarinasab MP, Khanian SE, Nikmard M, Molaee V. Genetic diversity of a native chicken breed in Iran. J Genet 2012;91:1–4.
Choi NR, Seo DW, Jemaa SB, Sultana H, Heo KN, Jo C, et al. Discrimination of the commercial Korean native chicken population using microsatellite markers. J Anim Sci Technol 2015;57(5):1–8.
Huo JL, Wu GS, Chen T, Huo HL, Yuan F, Liu LX, et al. Genetic diversity of local Yunnan chicken breeds and their relationships with red junglefowl. Genet Mol Res 2014;13(2):3371–3383.
Suh S, Sharma A, Lee S, Cho C, Kim J, Choi S. Genetic Diversity and Relationships of Korean Chicken Breeds Based on 30 Microsatellite Markers. Asian Australas J Anim Sci 2014;27(10):1399–1405.
Yang K, Luo X, Wang Y, Yu Y, Chen Z. Eight trinucleotide microsatellite DNA markers from Tibetan chicken, Gallus gallus domesticus. Conserv Genet Resour 2009;1:225–237.
Chatterjee RN, Bhattacharya TK, Dange M, Dushyanth K, Niranjan M, Reddy BLN, et al. Genetic heterogeneity among various Indigenous and other chicken populations with microsatellite markers. J Appl Anim Res 2015;43(3):266–271.
Yang K, Luo X, Wang Y, Yu Y, Chen Z. Ten polymorphic microsatellite loci in Tibetan chicken, Gallus gallus domesticus. Conserv Genet 2010;11(3):671–683.
Snyder L. Freifelder AD, Hartl DL. General genetics. UK: Jones and Bartlett publishers, Inc.;1985.
Ramadan S, Kayang BB, Inoue E, Nirasawa K, Hayakawa H. Evaluation of genetic diversity and conservation priorities for Egyptian chickens. Open J Anim Sci 2012;2(3):183–190.
Dorji N, Duangjinda M, Phasuk Y. Genetic characterization of Bhutanese native chickens based on an analysis of Red Jungle fowl (Gallus gallus gallus and Gallus gallus spadecieus), domestic Southeast Asian and commercial chicken lines (Gallus gallus domesticus). Genet Mol Biol 2012;35(3):603–609.
Ding FX, Zhang GX, Wang JY, Li Y, Zhang LJ, Wei Y, et al. Genetic diversity of a Chinese native chicken breed, Bian chicken, based on twenty-nine microsatellite markers. Asian-Australasian J Anim Sci 2010;23(2):154–161.
Zhao J, Li H, Kong X, Tang Z. Identification of single nucleotide polymorphisms in avian uncoupling protein gene and their association with growth and body composition traits in broilers. Can J Anim Sci 2006;345–350.
Noah O, Ngeranwa JJN, Binepal YS, Kahi AK, Bramwel WW, Ateya LO, et al. Genetic diversity of indigenous chickens from selected areas in Kenya using microsatellite markers. J Genet Eng Biotechnol 2017;15(2):489–495.
Kumar V, Mathew J, Sharma D, Kumar V, Shukla SK, Mathew J, et al. Genetic diversity and population structure analysis between Indian Red Jungle fowl and domestic chicken using microsatellite markers. Anim Biotechnol 2015;37–41.
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