Frecuencia de SNP en genes candidatos para crecimiento y su efecto en caracteres de peso vivo en ganado para carne de Tamaulipas
DOI:
https://doi.org/10.22319/rmcp.v11i1.4684Palabras clave:
ganado de carne, eje somatotrópico, asociación de SNP, frecuencias alélicas, peso vivoResumen
El objetivo del estudio fue analizar las frecuencias alélicas de 28 Polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) localizados en genes candidatos para crecimiento en bovinos, así como determinar su efecto sobre rasgos de peso vivo en hatos de las razas Charolais y Simmental. Se tomaron muestras de pelo de 313 animales provenientes de cinco hatos ubicados en cuatro municipios de Tamaulipas y se genotipificaron con la tecnología de Sequenom Mass Array.
Todos los marcadores resultaron ser polimórficos en las poblaciones evaluadas y sus frecuencias alélicas fueron significativamente diferentes entre razas (P<0.05). El análisis de asociación determinó que en los animales de la raza Charolais, el marcador PRL+2723 tiene un efecto significativo (P=0.0350) sobre el peso al nacimiento y el marcador localizado en el gen GHR (GHR-6.1), sobre peso al destete (P=0.0226). El GHR-6.1 también se asoció con el peso al año en los animales de la raza Simmental. El marcador LEP-3100 (P=0.0249) también tuvo un efecto significativo sobre el peso al destete en los animales Simmental.
El panel probado es polimórfico en las dos razas evaluadas y tres de los marcadores tuvieron efecto significativo en los parámetros de peso vivo evaluados, por lo que tienen el potencial de validarse y usarse como una herramienta adicional en la selección y mejoramiento genético del ganado de carne en Tamaulipas.
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Glazier AM, Nadeau JH y Aitman TJ. Finding genes that underlie complex traits. Science 2002;(298):2345-2349.
Jahuey-Martínez FJ, Parra-Bracamonte GM, Sifuentes-Rincón AM, Martínez-González JC, Gondro C, García-Pérez CA, et al. Genome-wide association analysis of growth traits in Charolais beef cattle. J Anim Sci 2016;94(11):4570-4582.
Takasuga A. PLAG1 and NCAPG-LCORL in livestock. J Animal Sci. 2016; (87):159–167.
Luna-Nevarez P, Rincon G, Medrano JF, Riley DG, Chase CC, Coleman SW, et al. Single-nucleotide polymorphisms in the growth hormone-insulin-like growth factor axis in straight bred and crossbred Angus, Brahman, and Romosinuano heifers: Population genetic analyses and association of genotypes with reproductive phenotypes. J Anim Sci 2011;(89):926-934.
Sherman EL, Nkrumah JD, Murdoch BM, Li C, Wang Z, Fu A et al. Polymorphisms and haplotypes in the bovine neuropeptide Y, growth hormone receptor, ghrelin, insulin-like growth factor 2, and uncoupling proteins 2 and 3 genes and their associations with measures of growth, performance, feed efficiency, and carcass merit in beef cattle. J Anim Sci 2008;(86):1–16.
Lu A, Hu X, Chen H, Jiang J, Zhang C, Xu H, et al. Single nucleotide polymorphisms in bovine PRL gene and their associations with milk production traits in Chinese Holsteins. Mol. Biol. Rep 2010;(37):547-551.
da Silva RCG, Ferraz JBS, Meirelles FV, Eler JP, Balieiro JCC, Cucco DC, et al. Association of single nucleotide polymorphisms in the bovine leptin and leptin receptor genes with growth and ultrasound carcass traits in Nellore cattle. Genet Mol Res 2012;11(4):3721-3728.
De la Rosa-Reyna XF, Montoya-Martínez HM, Castrellón VV, Sifuentes-Rincón AM, Parra-Bracamonte GM y Arellano-Vera W. Polymorphisms in the IGF1/Sna B1 gene and their effect on growth traits in Mexican beef cattle. Genet Mol Res 2010;9(2):875-883.
Cheong HS, Yoon DH, Park BL, Kim LH, Bae JS, Namgoong S, et al. A single nucleotide polymorphism in CAPN1 associated with marbling score in Korean cattle. BMC Genet. 2008;(9):33-10.
Oikonomou G, Michailidis G, Kougioumtzis A, Avdi M, Banos G. Effect of polymorphisms at the STAT5A and FGF2 gene loci on reproduction, milk yield and lameness of Holstein cows. Res Vet Sci. 2011;91(2):235-239.
Ruprechter G, Carriquiry M, Ramos JM, Pereira I, Ana M. Metabolic and endocrine profiles and reproductive parameters in dairy cows under grazing conditions: effect of polymorphisms in somatotropic axis genes. Acta Vet Scand 2011;53:35.
Parra GM, Lopez N, Sifuentes AM, Morris S, Lopez LA, Meza LA. Single and composite influence of growth-related candidate gene polymorphisms on additive genetic variation of birth weight in Charolais beef cattle. Trop. Anim. Health Prod 2014;(46):509-512.
Paredes-Sánchez FA; Sifuentes-Rincón AM; Segura-Cabrera A, García-Pérez CA, Parra-Bracamonte GM y Ambriz-Morales P. Associations of SNP located at candidate genes to bovine growth traits prioritized with an interaction networks construction approach. BMC Genet 2015;16(91):1-12.
Kalinowski ST, Taper ML y Marshall TC. Revising how the computer program CERVUS accommodates genotyping error increases success in paternity assignment. Mol Ecol 2007;(6):1099-1106.
Rousset F. Genepop'007: a complete reimplementation of the Genepop software for Windows and Linux. Mol. Ecol. Resour 2008;8:103-106.
Schenkel FS, Miller SP, Yee X, Moore SS, Nkrumah JD, Li C, et al. Association of single nucleotide polymorphisms in the leptin gene with carcass and meat quality traits of beef cattle. J Anim Sci 2005;(83):2009–2020.
Unanian M, Barreto C, Ribeiro-de Freitas A, Torres C y Josahkian, LA. Associations between growth hormone gene polymorphism and weight traits in Nellore bovines. R. Bras. Zootec. 2000;(29):1380-1386.
Siadkowska E, Zwierzchowski L, Oprzadek J y Strzalkowska N. Effect of polymorphism in IGF-1 gene on production traits in Polish Holstein-Friesian cattle. Anim. Sci. Pap. Rep. 2006;(3):225-237.
Matos-Almeida S, Amazonas E, TerraI G, Pereira J, Bayard Dias P y de Azevedo T. Association between molecular markers linked to the Leptin gene and weight gain in postpartum beef cows. Cienc Rural 2007;37(1):206-211.
Orrù L, Cifuni GF, Piasentier E, Corazzib M, Bovolenta S y Moioli B Association analyses of single nucleotide polymorphisms in the LEP and SCD1 genes on the fatty acid profile of muscle fat in Simmental bulls. Meat Sci 2011;(87):344–348.
Tatsuda K, Oka A, Iwamoto E, Kuroda Y, Takeshita H, Kataoka H, et al. Relationship of the bovine growth hormone gene to carcass traits in Japanese black cattle. J Anim Breed Genet 2008;(125):45–49.
Grochowska R, Lundén A, Zwierzchowski L, Snochowski M y Oprzadek J. Association between gene polymorphism of growth hormone and carcass traits in dairy bulls. Anim Sci 2001;(72): 441–447.
Buchanan FC, Fitzsimmons CJ, Van Kessel AG, Thue TD, Winkelman-Sim DC y Schmutz SM. Association of a missense mutation in the bovine leptin gene with carcass fat content and leptin mRNA levels. Genet. Sci. Evol. 2002;(34):105-116.
Pacheco-Contreras VI, Parra-Bracamonte GM, López-Bustamante LA, Moreno-Medina VR y Sifuentes-Rincón AM. Milk composition and its relationship with weaning weight in Charolais cattle. Rev. Bras. Zootec. 2015;(44):207-212.
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