Análisis de pedigrí en la determinación de la diversidad genética de poblaciones bovinas para carne mexicanas
DOI:
https://doi.org/10.22319/rmcp.v9i4.4654Palabras clave:
Tamaño población, Consanguinidad, Número ancestros, Intervalo generacional.Resumen
El objetivo de este estudio fue evaluar la diversidad genética de siete poblaciones de bovinos para carne en México, mediante análisis de sus pedigríes. Los análisis se realizaron con el programa Endog, utilizando información de los animales inscritos en el libro genealógico nacional de cada raza. Los tamaños de los pedigríes estudiados fueron: Angus (AN)= 73,271; Brangus Negro (BN)= 68,474; Brangus Rojo (BR)= 12,925; Hereford (HE)= 13,248; Limousin (LI)= 53,221; Salers (SA)= 14,065; y Suizo Europeo (SE)= 184,788. En general, las poblaciones mostraron mejoras importantes en la integridad de sus pedigríes en los 10 años más recientes, con parámetros comparables a los publicados en otras poblaciones de bovinos. El intervalo generacional varió de 5.1 a 7.2 años entre razas. Los coeficientes de consanguinidad y de relación genética aditiva promedio fueron relativamente bajos en las diferentes poblaciones (0.9-4.2 y 0.3-6.5 %, respectivamente); aunque en algunas razas (BN, BR y HE) se detectaron incrementos de estos indicadores en los 10 años más recientes. El tamaño efectivo de población fluctuó entre 24 y 192, con valores menores que 50 en BR y SA. Los parámetros relacionados con la probabilidad de origen de los genes indican que las contribuciones desbalanceadas de los animales fundadores, los cuellos de botella y la deriva genética, han tenido un efecto importante en las poblaciones actuales, con la consecuente pérdida de diversidad genética. Se recomienda continuar o adoptar estrategias de apareamiento que minimicen la consanguinidad, y el uso intensivo de pocos animales para mantener la variabilidad genética de futuras generaciones, así como ampliar la diversidad genética mediante el uso estratégico de genes provenientes de otros países.
Descargas
Citas
Santana Jr. ML, Pereira RJ, Bignardi AB, Ayres DR, Menezes GRO, Silva LOC, et al. Structure and genetic diversity of Brazilian Zebu cattle breeds assessed by pedigree analysis. Livest Sci 2016;187:6-15.
Sheikhlou M, Abbasi MA. Genetic diversity of Iranian Lori-Bakhtiari sheep assessed by pedigree analysis. Small Ruminant Res 2016;141:99-105.
Bernardes PA, Grossi DA, Savegnago RP, Buzanskas ME, Ramos SB, Romanzini EP, et al. Population structure of Tabapuã beef cattle using pedigree analysis. Livest Sci 2016;187:96-101.
Abeledo CM, Santana I, Hernández S, Acuña N, Gutiérrez M, Brache JF, et al. Parámetros poblacionales en cerdos CC21 cubanos a partir de su información genealógica. AICA 2017;9:122-128.
Barros EA, Brasil LHA, Tejero JP, Delgado-Bermejo JV, Ribeiro MN. Population structure and genetic variability of the Segureña sheep breed through pedigree analysis and inbreeding effects on growth traits. Small Ruminant Res 2017;149:128-133.
Ruíz-Flores A, Núñez-Domínguez R, Ramírez-Valverde R, Domínguez-Viveros J, Mendoza-Domínguez M, Martínez-Cuevas E. Niveles y efectos de la consanguinidad en variables de crecimiento y reproductivas en bovinos Tropicarne y Suizo Europeo. Agrociencia 2006;40:289-301.
Domínguez-Viveros J, Rodríguez-Almeida FA, Ortega-Gutiérrez JA, Santellano-Estrada E. Análisis de la información genealógica y estimación de parámetros de poblaciones en bovinos de Lidia y equinos de pura raza española de México. Rev Cient - Fac Cienc Vet 2012;22:443-450.
Ramírez-Valverde, R., R. Núñez-Domínguez, y E. Fabián-Ramos. 2014. Caracterización de las publicaciones sobre mejoramiento genético animal en revistas científicas mexicanas. Ecosist Recur Agropec 2014;1(1):59-72.
Ríos UÁ. 2010. Evaluación genética nacional. In: Montaño BM, Martínez VG Editores. Guía técnica de control de producción y mejoramiento genético en bovinos para carne. México, D. F.: Editado por SAGARPA-CONARGEN; 2010:32-44.
Gutiérrez JP, Goyache F. A note on Endog: a computer program for analyzing pedigree information. J Anim Breed Genet 2005;122:172-176.
Boichard D, Maignel L, Verrier E. The value of using probabilities of gene origin to measure genetic variability in a population. Genet Sel Evol 1997;29:5-23.
Boichard D, Maignel L, Verrier E. Analyse généalogique des races bovines laitières françaises. Prod Anim 1996;9(5):323-335.
Gutiérrez JP, Altarrabia J, Díaz C, Quintanilla R, Cañón J, Piedrafita J. Pedigree analysis of eight Spanish beef cattle breeds. Genet Sel Evol 2003;35:43-63.
Meuwissen THE, Luo Z. Computing inbreeding coefficients in large populations. Genet Sel Evol 1992;24:305-3013.
Cervantes N. Estructura genética del caballo de pura raza árabe español y su influencia en razas derivadas: aplicación de nuevas metodologías en el cálculo del tamaño efectivo [Tesis Doctoral]. Madrid, España. Universidad Complutense de Madrid; 2008.
Wright S. Evolution in Mendelian populations. Genetics 1931;16:97-159.
Falconer DS, Mackay TFC. Introduction to Quantitative Genetics. Fourth Edition. Halow, England: Longman Group Ltd; 1996.
Gutiérrez JP, Cervantes I, Molina A, Valera M, Goyache F. Individual increase in inbreeding allows estimating realized effective sizes from pedigrees. Genet Sel Evol 2008;40:359-378.
Gutiérrez JP, Cervantes I, Goyache F. Improving the estimation of realized effective population sizes in farm animals. J Anim Breed Genet 2009;126:327-332.
Lacy R. Analysis of founder representation in pedigrees: founder equivalents and founder genome equivalents. Zoo Biol 1989;14:565-578.
Bozzi R, Franci O, Forabosco F, Pugliese C, Crovetti A, Filippini F. Genetic variability in three Italian beef cattle breeds derived from pedigree information. Ital J Anim Sci 2006;5:129-137.
Bouquet A, Venot E, Laloë D, Forabosco F, Fogh A, Pabiou T, et al. Genetic structure of the European Charolais and Limousin cattle metapopulations using pedigree analyses. J Anim Sci 2011;89:1719-1730.
Martínez RA, García D, Gallego JL, Onofre G, Pérez J, Cañón J. Genetic variability in Colombian Creole cattle populations estimated by pedigree information. J Anim Sci 2008;86:545–552.
Peixoto MGCD, Poggian CF, Verneque RS, Egito AA, Carvalho MRS, Penna VM, et al. Genetic basis and inbreeding in the Brazilian Guzerat (Bos indicus) subpopulation selected for milk production. Livest Sci 2010;131:168-174.
Maignel L, Boichard D, Verrier E. Genetic variability of French dairy breeds estimated from pedigree information. Interbull Bulletin 1996;14:49-54.
Santana Jr. ML, Oliveira PS, Eler JP, Gutiérrez JP, Ferraz JBS. Pedigree analysis and inbreeding depression on growth traits in Brazilian Marchiguiana and Bonsmara breeds. J Anim Sci 2012;90:99-108.
Mc Parland S, Kearney JF, Rath M, Berry DP. Inbreeding trends and pedigree analysis of Irish dairy and beef cattle populations. J Anim Sci 2007;85:322-331.
Carolino N, Gama LT. Indicators of genetic erosion in an endangered population: The Alentejana cattle breed in Portugal. J Anim Sci 2008;86:47-56.
Gebremariam W, Forabosco F, Zumbach B, Palucci V, Jorjani H. Characterization of the global Brown Swiss cattle population structure. Interbull Bulletin 2010;42:16-20.
Pirchner F. Population genetics in animal breeding. New York, USA: Plenum Press; 1983.
Kadlecík O, Pavlík I. Genealogical analysis in small populations: The case of four Slovak beef cattle breeds. Slovak J Anim Sci 2012;45:111-117.
Goyache F, Gutiérrez JP, Fernández I, Gómez E, Álvarez I, Díez J, et al. Using pedigree information to monitor genetic variability of endangered populations: The Xalda sheep breed of Asturias as an example. J Anim Breed Genet 2003;120:95-105.
Ivanković, A., J. Ramljak, N. Kelava, and M. Konjačić. Pedigree analysis of the Croatian autochthonous cattle breeds: Management of conservation strategy. STOČARSTVO 2010;63:3-15.
Dunner S, Checa ML, Gutiérrez JP, Martin JP, Cañon J. Genetic analysis and management in small populations: The Asturcon pony as an example. Genet Sel Evol 1998;30:397-405.
Verrier E, Colleau JJ, Foulley JL. Long-term effects of selection based on the animal model BLUP in a finite population. Theor Appl Genet 1993;87:446-454.
FAO. Secondary guidelines for development of national farm animal genetic resources management plans: Management of small populations at risk. Rome, Italy: FAO; 1998.
Henson EL. In-situ conservation of livestock and poultry. Rome, Italy: FAO Animal Production and Health Paper 99; 1992.
Cervantes I, Goyache F, Molina A, Valera M, Gutiérrez JP. Application of individual increase in inbreeding to estimate effective sizes from real pedigrees. J Anim Breed Genet 2008;125:301-310.
Danchin-Burge C, Leroy G, Brochard M, Moureaux S, Verrier E. Evolution of the genetic variability of eight French dairy cattle breeds assessed by pedigree analysis. J Anim Breed Genet 2012;129:206-217.
Santana Jr. ML, Pereira RJ, Bignardi AB, El Faro L, Tonhati H, Albuquerque LG. History, structure, and genetic diversity of Brazilian Gir cattle. Livest Sci 2014;163:26-33.
Sorensen AC, Sorensen MK, Berg P. Inbreeding in Danish dairy cattle breeds. J Dairy Sci 2005;88:1865-1872.
Vozzi PA, Marcondes CR, Magnabosco CU, Bezerra LAF, Lobo RB. Structure and genetic variability in Nellore (Bos indicus) cattle by pedigree analysis. Genet Mol Biol 2006;29:482-485.
Publicado
Cómo citar
-
Resumen1653
-
PDF983
-
XML901
Número
Sección
Licencia
Los autores/as que publiquen en la Revista Mexicana de Ciencias Pecuarias aceptan las siguientes condiciones:
De acuerdo con la legislación de derechos de autor, la Revista Mexicana de Ciencias Pecuarias reconoce y respeta el derecho moral de los autores/as, así como la titularidad del derecho patrimonial, el cual será cedido a la revista para su difusión en acceso abierto.
Esta obra está bajo una Licencia Creative Commons Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional.